1) Лаборатория синтеза оптических материалов (заведующий – Игнатьев А.И.)
2) Лаборатория характеризации материалов (заведующий – Нурыев Р.К.)
3) Лаборатория фотоники (заведующий – Асеев В.А.)
4) Лаборатория голографии (заведующий – д.ф-м.н. Щеулин А.С.)
5) Лаборатория спектроскопии кристаллов (заведующий – к.ф.-м.н. Ангервакс А.Е.)
6) Лаборатория синтеза и спектроскопии нанокомпозитов (заведующий – профессор, д.ф.-м.н. Ермолаев В.Л.)
7) Лаборатория дифракционных решеток (заведующий – к.т.н. Уханов Е.В.)
8) Лаборатория космической оптики и материалов (заведующий – Рохмин А.С.)
9) Лаборатория УФ и ИК материалов (заведующий – Погумирский М.В.)